宁远九嶷河国家湿地公园管理局为县政府直属正科级公益一类事业单位，内设办公室、保护管理科、科普宣教科、科研监测科、规划建设与旅游发展科。负责湿地公园规划控制区的规划建设、保护管理和开发利用，联合湖南省九嶷山文旅集团开展青少年自然教育研学实践。
九嶷河国家湿地公园科普宣教设施完善，拥有“一馆一廊一园一校”科普场所，即湿地科普馆、沿河宣教长廊、湿地植物园、鲁观完小湿地自然学校，含644亩宣教展示区、50亩体验拓展区，4000平方米宣教中心，其中室内宣教展馆800平方米。配套建设了研学食宿基地以及科普广场、停车场、公厕、环保、气象、供电、监控等设施，组建了约50人的自然研学科普师资队伍，可同时接纳500余名中小学生开展湿地科普和研学实践活动。